課題組長簡介

熊旭深 博士，浙江大學醫學中心、良渚實驗室“百人計劃”研究員，博士生導師。

熊旭深2014年本科畢業于華中科技大學生物信息學專業；2019年博士畢業于北京大學生命科學學院伊成器教授課題組；2019年起以聯合博士后身份在麻省理工計算機與人工智能系 Manolis Kellis 教授 (Head, MIT Computational Biology group) 及哈佛醫學院 Richard Gregory 教授課題組進行計算生物學及疾病表觀遺傳學方向的研究。2022年底，熊旭深博士加入浙江大學醫學中心/良渚實驗室，成立獨立課題組。

熊旭深博士長期從事以計算生物學和實驗生物學手段相結合（“干濕結合”）的方式進行遺傳疾病的多組學調控機制研究，以第一作者或者共同第一作者發表Nature Genetics, Molecular Cell, Nature Chemical Biology等多篇高水平文章。Google Scholar 引用超過1500次，H-index=11，獲2019年“吳瑞獎學金”。

熊旭深博士參與發現了mRNA上m1A新型甲基化修飾，為表觀轉錄組在癌癥的研究開辟了新的方向 (Nat Cell Biol. 2016, Mol Cell. 2017, Nat Comm. 2021)，其關于m6A (Nat Genet., 2021) 及 H3K27ac (Nat Genet., In Revision) 的遺傳學調控的研究為解析遺傳疾病的遺傳學位點提供了新的思路和不同層次 ，其關于阿爾茲海默癥的遺傳致病位點定位及調控解析為尋找可轉化的靶位點提供了重要的分子基礎 (Cell, In Revision)。

課題組研究方向

本課題組致力于利用計算生物學、人工智能、實驗生物學等多學科交叉的手段進行人類遺傳疾病的跨層次多組學（epigenomics, RNA modification, transcriptomics, etc）機制研究。具體包括以下3個方向：

1. 基于生物信息學和遺傳統計學的多基因遺傳疾病（心血管、腦部遺傳疾病等）的多組學（表觀基因組、RNA修飾組、轉錄組、翻譯組等）整合分析及因果推斷；

2. 基于機器學習（主要是深度學習）的表觀基因組和表觀轉錄組的預測及關鍵調控序列及遺傳位點的鑒定；

3. 基于Organoid，iPSC，動物模型等體外體系及Perturb-seq, CRISPR screening等高通量實驗手段的調控通量機制研究及驗證。

一、崗位要求

（一）博士后

1、計算生物學、遺傳統計學、人工智能方向（數名）

a)近期（或即將）取得生物信息、計算機、數學、統計、物理、數據科學等相關領域的博士學位（無優先順序）；

b) 具備扎實的編程能力，具有概率統計、基因組學、深度學習方面知識；

c) 以第一作者（含共同）發表過SCI論文，有一定的獨立工作能力；

d) 對生物信息學或人工智能在基因組學中的應用有研究興趣，有責任心與團隊合作精神；

e) 擁有較為良好的英語溝通和寫作能力。

2、實驗生物學方向（數名）

a) 近期（或即將）取得細胞生物學、生物化學與分子生物學等相關領域的博士學位；

b) 具有扎實的細胞培養、文庫構建、生物分子等相關實驗技能；

c) 以第一作者（含共同）發表過SCI論文，有一定的獨立工作能力；

d) 對以干濕結合的方式進行遺傳學機制研究有興趣，有責任心與團隊合作精神；

e) 擁有較為良好的英語溝通和寫作能力；

f) 具有Organoid，iPSC等體外體系建立，及Perturb-seq, CRISPR screening, 單細胞建庫等高通量實驗相關經驗者優先。

（二）科研助理/技術員

1、生物信息學、統計遺傳學方向（1-2名）

a) 近期（或即將）取得生物信息、計算機、數學、統計、物理、數據科學等相關領域的本科或碩士學歷（無優先順序）；

b) 具有一定的編程能力，具有數理統計或測序數據分析基礎；

c) 對生物信息學或基因組學有研究興趣，有責任心與團隊合作精神；

d) 發表過SCI論文的優先。

2、實驗生物學方向（1-2名）

a) 近期（或即將）取得生命科學、醫學等相關領域的本科或碩士學歷；

b) 具有細胞培養、文庫構建、生物分子等相關實驗技能；

c) 對以干濕結合的方式進行遺傳學機制研究有興趣，有責任心與團隊合作精神；

d) 發表過SCI論文的優先。

（三）博士研究生

1、 具有推免資格或符合浙江大學醫學院“申請審核”制博士研究生招考要求;

2、 對科學研究充滿熱情，對未知領域勇于探索，善于發現問題和解決問題；

3、 接受過系統的科研訓練，具有嚴謹的科學態度；

4、 具有出色的英文讀寫和溝通能力；

5、 善于溝通交流，有良好的責任心和團隊協作精神。

二、薪酬待遇

（一）博士后

1、按照本單位博士后管理規定，提供專業的科研指導和具有競爭力的待遇年薪23萬+，優秀者一人一議；

2、 支持申報博士后科學基金以及其他國家與地方科研項目；

3、課題組與麻省理工、哈佛醫學院等研究機構有合作聯系，表現優異者有機會申請國際交流或推薦聯合培養；

4、提供一流的科學研究條件和指導，及參加國內外高水平學術會議的機會 ；          

5、 課題組提供積極的工作環境與靈活的工作制度，為成員的職業規劃和發展提供最大可能的指導和幫助，博士后出站優秀者有機會申報良渚實驗室特聘研究員或副研究員，入職杭州工作者可獲得政府資助的安家費及各種人才補貼。

（二）科研助理

課題組提供積極的工作環境與靈活的工作制度，為成員的職業規劃和發展提供最大可能的指導和幫助，薪資待遇視具體情況，一事一議。

三、招聘程序

請有意者請將以下材料電子版發送到電子郵箱：xiongxs@mit.edu和xiongxushen1992@gmail.com。詳細的個人簡歷（包括學習工作經歷、主要研究工作內容、代表性論文論著清單、獲獎情況）及申請人認為其他有借鑒意義的材料。郵件標題請注明“姓名_申請博士后/科研助理/研究生 ”。對于符合要求并通過初審者，將會通知安排面試。應聘材料將予以保密。 

為防止簡歷投遞丟失請抄送一份至：boshijob@126.com（郵件標題格式：應聘職位名稱+姓名+學歷+專業+中國博士人才網）