實驗室/課題組簡介
開展人工智能超級計算精準藥物發現研究,把最新的人工智能工具用于預測藥物-靶標相互作用,疫苗靶向設計以及藥物篩選(Nature MI),重定位和全新設計實踐之中。開發了AI藥物發現軟件SAMM,把深度學習等非線性方法開發了統計預測模型以及基于web的軟件工具并應用到藥物構效關系,藥物代謝以及毒理和基因表型相關性的研究中,開發ADMET在線預測平臺,并將其應用到各種典型體系。通過超大規模的高性能計算和虛擬篩選,我們發現花椒有效成分WGX-50具有極強的抗炎癥和抗氧化作用,再抗衰老產品開發中得到了很好的應用。開展新冠的生物信息學研究,發現了幾個中藥有效成分具有抗新型冠狀病毒作用,篩選出了一個新冠病毒的有效多肽抑制劑——人腸防御素5。通過掩蔽受體,人血管緊張素轉化酶2(ACE2)抑制新冠病毒突刺蛋白對人黏膜細胞的侵襲,從而阻斷新冠病毒傳染途徑,論文發表在Gastroenterology之上,它解釋了為何病毒不通過消化系統傳染。被“Faculty Opinions”選作推薦論文,并由德國基爾大學的免疫學專家Jens-Michael Schröder 教授進行點評,評論指出了該項工作給預防或治療新冠肺炎提供全新途徑—既可以使用HD5作為治療藥物,也可以通過刺激內源性HD5的合成來預防或治療。為此,魏冬青被評為上海市微生物學會抗疫突出貢獻優秀會員。
PI簡介
魏冬青,上海交通大學生命科學技術學院長聘教授,皇家化學學會會士,長期從事生物信息學、人工智能輔助藥物設計的研究工作,再交叉學科諸多領域做出了開拓性的工作,特別是首次從理論上證明了特別液晶的存在,首次揭示爆炸微觀反應機理以及發現并驗證了花椒素的抗衰老作用。在Gastroenterology、JACS、Physical Review Letters、Briefings in Bioinformatics、Journal of Chemical Theory and Computation等國際期刊發表了學術論文600多篇,主編專著12本,累計引用超1萬3千多次,H-index63;H10-index252。開發了多款數據庫、深度學習、分子模擬和藥物設計軟件,獲軟件著作權近20項;獲得上海市科技進步一等獎,中華醫學二等獎,中國計算機學會自然科學二等獎等;擔任Springer期刊“Interdisciplinary Sciences–Computational Life Sciences”(交叉科學–計算生命科學)主編、現代計算機輔助藥物設計(CCADD)主編,中國衛生信息學會大數據應用評估與保障專業委員會副主委,生物工程學會生物信息專委會副主委。
應聘條件
2、近三年內在國內外獲得博士學位,年齡35周歲以下;生物信息學,計算生物學、計算機,數據科學等相關專業;
3、具有Python,Perl或者R等編程基礎,具備一定的數據建模及機器學習(深度學習)建模技能,有人工智能項目開發經驗者優先。
4、有志從事人工智能藥物開發研究;具備創新精神、獨立工作能力和團隊協作精神;具有良好的英文寫作與溝通能力;以第一作者的身份發表SCI研究論文至少1篇(其中一篇影響因子大于3.0)。
崗位職責
1、人工智能抗COVID-19藥物與疫苗設計
2、抗衰老實驗研究
3、深度學習在計算生物學中的應用
4、蛋白機器的計算機模擬
崗位待遇
1、年薪不低于24萬元(按上海交通大學博士后相關規定執行);
2、實驗室提供良好的科研條件(計算資源)和充足穩定的經費支持,支持博士后在站期間申報各項研究項目,如“博士后創新人才支持計劃”、“上海市超級博士后計劃”、“國家自然科學基金青年項目”、“中國博士后科學基金”等,獲資助者享受相關待遇(薪酬大幅度提升);
3、按照上海市和上海交通大學博士后相關政策享受待遇(落戶、博士后公寓、五險一金等,詳見網站https://postd.sjtu.edu.cn/)。
4、博士后首聘期為2年。上海交通大學為優秀博士后提供專有晉升通道。條件優秀者出站后可直接申請上海交通大學長聘教軌與研究系列教師。
聯系方式
請申請者將個人簡歷、代表性論文全文、博士論文中文摘要、研究工作經歷和至少兩位推薦人的姓名,并簡要說明申請理由,將聯系方式發送至dqwei@sjtu.edu.cn(郵件標題注明:應聘某某崗位+本人姓名 )。
聯系人:魏冬青教授
聯系地址:上海市閔行區東川路800號上海交通大學生命科學技術學院
網址:http://tacc2008.sjtu.edu.cn/
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為防止簡歷投遞丟失請抄送一份至:boshijob@126.com(郵件標題格式:應聘職位名稱+姓名+學歷+專業+中國博士人才網)
中國-博士人才網發布
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